Cara membedakan anakan ikan guppy jantan dan betina adalah dengan memperhatikan bentuk tubuh dan siripnya. Umumnya, ikan guppy jantan memiliki tubuh yang lebih ramping dan sirip yang lebih panjang dan berwarna cerah dibandingkan dengan ikan guppy betina. Selain itu, ikan guppy jantan juga memiliki bintik-bintik hitam di sepanjang tubuhnya, sedangkan ikan guppy betina tidak.
Mengetahui cara membedakan anakan ikan guppy jantan dan betina sangat penting bagi para peternak ikan guppy. Dengan mengetahui jenis kelamin ikan guppy sejak dini, peternak dapat mengatur perkembangbiakan ikan guppy dengan baik dan mencegah terjadinya perkawinan sedarah. Selain itu, mengetahui jenis kelamin ikan guppy juga dapat membantu peternak dalam menentukan harga jual ikan guppy, karena ikan guppy jantan umumnya memiliki nilai jual yang lebih tinggi dibandingkan dengan ikan guppy betina.