Karantina ikan koi merupakan proses isolasi ikan koi yang baru dibeli atau berasal dari tempat lain untuk mencegah penyebaran penyakit ke dalam kolam utama. Proses ini sangat penting untuk menjaga kesehatan ikan koi dan mencegah kerugian finansial akibat penyakit.
Karantina ikan koi biasanya dilakukan selama 2-4 minggu. Selama periode ini, ikan koi akan diobati dengan obat-obatan untuk mencegah atau mengobati penyakit. Ikan koi juga akan dipantau kesehatannya secara teratur untuk memastikan tidak ada tanda-tanda penyakit.